O Sapiens Parque está desenvolvendo o primeiro Jardim Botânico de Santa Catarina, com 323,7 mil m², coordenado pela Fapesc e Epagri com a parceria da ACIF e Floram. Oficialmente registrado e enquadrado nos requisitos do Conselho Nacional do Meio Ambiente (Conama), o Jardim Botânico deve ser implantado e distribuído em três grandes áreas de Florianópolis, sendo uma delas no Sapiens Parque.
O projeto físico prevê área administrativa, biblioteca, estufas, laboratórios, locais de lazer, salas de educação ambiental e agrária, área de alimentação e de exposição de produtos da agricultura familiar e pesca regional. As atividades científicas planejadas incluem a busca e coleta de sementes, a troca de material botânico para ampliação de coleções de espécies e venda de mudas, entre outras. Uma parte da área será transformada em Unidade Ambiental de Conservação.